Proteínas, proteínas...

Por acá está la presentación de aquélla tarde de sueño

Acá está el tutorial teo-práctico

El alineamiento para cartografiar sobre la estructura, es éste

Finalmente, la proteína en cuestión parece ser ésta

Ah ... el script para mapear conservación de un MSA sobre la estructura 3D, es éste

HMM y variantes del BLAST

Diapos de matrices y HMMs.

Este es el pequeño tutorial de modelos de markov escondidos.

Y acá tienen el genoma sobre el que harán el laburito...

En lugar del file '850homologos.fa', usen este archivo de secuencias para alinear al perfil HMM

Aqui hay un minitutorial de variantes de BLAST y unas secuencias para trabajar

alineamiento multiple

Esta es la parte de alineamiento multiple
Diapos

Practico

Secuencias

Archivo para alinear nucleótidos basados en aa

Alineamiento de 2 secuencias

· Bases para el alineamiento de dos secuencias, algoritmos óptimos, globales y locales. Elementos de su evaluación estadísitcica. (Diapos)

· Métodos heurísticos de alineamiento, BLAST y búsqueda en bases de datos. (Diapos).

Práctico de dot-plot y alineamientos óptimos

Práctico de blast local; y archivos para poder seguir el protocolo

Bases de datos

En esta parte del cursillo vamos a aprender rudimentos de bases de datos relacionales utilizando el Sistema de Gestion de Bases de Datos Relacionales postgresSql.

Diapos

Tutorial